Con la cantidad de frameworks para crear themes para WordPress que existen, tal vez quieras animarte a crear uno y posiblemente quieras potenciarlo utilizando jQuery.
Agregar esta biblioteca es en verdad una tarea sencilla, esto es debido a que WordPress ya utiliza jQuery, seguramente lo habrás notado al momento de subir una imagen, cuando se abre el diálogo, éste utiliza un efecto similar al lightbox.
Entonces para incorporar jQuery en tu theme, sólo tienes que agregar en el archivo header.php, dentro de las etiquetas <head>…</head> el siguiente código:
<?php wp_enqueue_script("jquery"); ?>
Vía: How to include JQuery on your WordPress theme – Wp Recipes
Extra
Si en verdad está en tus planes crear tu propio theme WordPress, te recomiendo este post (en inglés) de Reencoded: 12 great tutorials on creating a new WordPress Theme.
