Para subir y administrar los archivos en un servidor es necesario un cliente de FTP.
Normalmente estos permiten navegar por las carpetas del servidor, también: subir, descargar, copiar, borrar, renombrar archivos y cambiar permisos.
Además de estos, existen clientes web como Net2FTP y FTPBIN que ofrecen todas las funcionalidades de sus pares de escritorio y además descomprimen archivos ZIP (ideal para instalar plugins) también instalan aplicaciones, editan texto, resaltan sintaxis, permiten buscar archivos, palabras y frases, pero sin dudas los más atractivo es poder acceder al servidor sin tener que instalar nada.
En estos casos, como se trata de la información alojada en un servidor, recomiendo las mismas precauciones a cuando por ejemplo se hacen operaciones bancarias.
Hace un tipo conocí y usé con excelentes resultados a Net2FTP, hoy vía Buscando la Libertadad me enteré de FTPBIN que durante ms prueba, mostró funcionalidades similares y además funcionó muy bien.